Nikolaj Pagh Kristensen

Om projektet

Immunrespons mod egne proteiner (dvs. autoantigener) kan føre til autoimmun sygdom. Dette er sandt for dyremodeller af multipel sklerose (MS), men selvom der er stærke data, der understøtter, at enkelte autoantigener driver neuroinflammation hos MS-patienter, er det fortsat indicier. Ved at kombinere state-of-the-art enkeltcelle sekventering (scSeq) med CRISPR/Cas9-medieret ortotopisk T-celle receptor (TCR) erstatning samt en genom-dækkende epitop undersøgelsesplatform, vil Nikolaj Pagh Kristensen forsøge at afdække nye autoantigener for CD4 og CD8 T-celler og løse fænotypisk heterogenitet af autoantigen-specifikke T-celler i cerebrospinalvæsken hos MS-patienter. Det vil føre til målrettede proteinmarkører til yderligere forskning og lægemiddeludvikling.

Til dette formål vil han udføre scSeq af T-celler, der infiltrerer cerebrospinalvæsken (CSF) hos MS-patienter. Identificerede TCR'er udtrykt i primære humane T-celler vil blive brugt som input til kortlægning af proteom-dækkende autoreaktivitet sammen med celle-reportere, der præsenterer et af 200.000 autoantigener. Endelig vil projektet parre autoantigen- og TCR-data for at øge scSeq-datasættet, der er registreret for de indledende CSF-prøver – for at definere markørgener, der identificerer autoantigen-specifikke CD4- og CD8-T-celler i CSF af MS-patologi.

Samlet set vil LF Postdoc-projektet give unik indsigt i MS-immunopatologi og dermed definere en ny grænse for MS-forskning og lægemiddeludvikling.